Налоговый контроль: изменения в подходах к проверкам бизнеса

В опубликованной ФНС статистике число выездных проверок сократилось со 116 в 2022 году до 29 в 2024 году. Средний результат одной проверки вырос с 51,9 млн ₽ в 2024 году до 69,3 млн ₽ за девять месяцев 2025 года. Эти данные не описывают всю страну, но показывают подход инспекции: проверок меньше, компании отбирают точнее.

С 1 января 2026 года действуют новые правила налогового контроля. Инспекция получила дополнительные полномочия при рассмотрении материалов проверки, а камеральную проверку теперь может вести уполномоченный ФНС налоговый орган. С 1 сентября 2026 года такой орган вправе рассматривать и жалобы.

Руководителю стоит проверить компанию по открытым критериям ФНС до того, как инспекция направит требование или назначит проверку.

Почему уменьшение числа проверок не снижает риск

Приказ ФНС России от 30 мая 2007 года № ММ-3-06/333@ закрепляет риск-ориентированный подход: инспекция анализирует показатели компании и выбирает налогоплательщиков с признаками возможного нарушения. В приказе перечислены 12 общедоступных критериев риска. ФНС продолжает применять эту систему и публикует отраслевые показатели для сравнения.

По данным ФНС, основным основанием для включения компании в план остаётся предполагаемое участие в незаконных схемах снижения налогов. До назначения выездной проверки налоговая служба отдаёт приоритет добровольному уточнению обязательств.

Само совпадение с одним критерием не доказывает нарушение и не означает, что проверку назначат. Инспекция оценивает показатели вместе: например, длительные убытки, высокую долю вычетов по НДС и операции с контрагентами, которые не располагают ресурсами для исполнения договора.

Практический вывод: ориентироваться на среднее число проверок бесполезно. Нужно смотреть, какие данные инспекция видит по вашей компании и чем вы объясните отклонения.

Какие показатели проверяет ФНС

Приказ ФНС России от 30 мая 2007 года № ММ-3-06/333@ называет 12 критериев самостоятельной оценки риска:

1. Налоговая нагрузка ниже среднего уровня по соответствующему виду деятельности.
2. Убытки в бухгалтерской или налоговой отчётности два календарных года и дольше.
3. Вычеты по НДС составляют 89% или больше от начисленного налога за 12 месяцев.
4. Расходы растут быстрее доходов от продажи товаров, работ или услуг.
5. Средняя зарплата ниже уровня по тому же виду деятельности в субъекте России.
6. Показатели неоднократно приближаются к предельным значениям специального налогового режима менее чем на 5%.
7. У индивидуального предпринимателя профессиональные налоговые вычеты превышают 83% дохода.
8. Компания работает через перекупщиков или посредников без разумной экономической цели.
9. Налогоплательщик не представляет пояснения или запрошенные документы.
10. Компания два раза или чаще меняет место постановки на налоговый учёт.
11. Рентабельность отклоняется от среднеотраслевой на 10% или больше.
12. Компания ведёт деятельность с высоким налоговым риском, в том числе работает с недобросовестными контрагентами.

ФНС ежегодно до 5 мая публикует среднеотраслевые показатели налоговой нагрузки и рентабельности. Для первичной проверки можно использовать сервисы ФНС «Риски бизнеса» и «Налоговый калькулятор».

После сравнения со среднеотраслевыми данными подготовьте пояснение по каждому заметному отклонению. Низкую рентабельность могут объяснять запуск нового направления, рост себестоимости или разовая крупная скидка. Убыток — вложения в оборудование или сокращение спроса. Но одного пояснения мало: его должны подтверждать договоры, расчёты цен, управленческие решения и первичные документы.

Отдельно проверьте операции через посредников. Договор должен отвечать на три вопроса: зачем посредник понадобился, какую работу он выполнил и что компания получила в результате. Если содержание документов расходится с фактическим исполнением, инспекция может исследовать операцию по правилам ст. 54.1 НК РФ. Подробнее — в разборе о том, из чего инспекция складывает вывод об искажении сделки.

Что изменилось с 1 января 2026 года

Федеральный закон от 28 ноября 2025 года № 425-ФЗ расширил возможности налогового контроля.

Во время дополнительных мероприятий при рассмотрении материалов проверки инспекция вправе осматривать территории и помещения, а также изымать документы и предметы. Раньше руководитель мог готовиться к осмотру и выемке прежде всего на этапе самой проверки. Теперь такой риск сохраняется и после составления акта, пока инспекция рассматривает материалы.

Практический совет: назначьте сотрудника, который сопровождает инспекторов и фиксирует их действия. Заранее определите:

• где хранятся оригиналы документов и электронные данные;
• кто выдаёт доступ в помещения и к информационным системам;
• как компания учитывает переданные или изъятые материалы;
• где находятся резервные копии;
• кто проверяет протоколы и замечания к ним.

Камеральную проверку с 1 января 2026 года вправе проводить не только инспекция, куда компания подала декларацию, но и другой налоговый орган, уполномоченный ФНС. По п. 1 ст. 88 НК РФ налогоплательщика должны уведомить о передаче проверки. ФНС разъясняет, что уведомление направляют не позднее пяти дней после получения информации о её проведении уполномоченным органом.

Не игнорируйте документ из незнакомой инспекции только потому, что компания там не состоит на учёте. Проверьте уведомление, основание требования и срок ответа. Документы и пояснения можно передать как в инспекцию, куда подали декларацию, так и в уполномоченный орган.

Какой период охватывает выездная проверка

По ст. 89 НК РФ инспекция вправе проверить три календарных года, которые предшествуют году вынесения решения. Закон № 425-ФЗ позволяет также включить завершённые налоговые периоды текущего года.

Сама выездная проверка длится не более двух месяцев. Её могут продлить до четырёх месяцев, а в исключительных случаях — до шести. Это не означает, что весь контроль закончится в этот срок: инспекция может приостанавливать проверку, запрашивать документы, проводить дополнительные мероприятия и рассматривать материалы.

После получения решения сверьте налоги, периоды и состав проверяющей группы. Срок проверки считают со дня вынесения решения, а не со дня, когда документ передали компании. Порядок расчёта сроков и проверки реквизитов решения разобран в материале о том, что контролировать после назначения выездной проверки.

Кто рассматривает жалобу с 1 сентября 2026 года

С 1 сентября 2026 года Закон № 425-ФЗ разрешает передавать жалобы, включая апелляционные, не только вышестоящему налоговому органу, но и органу, специально уполномоченному ФНС.

Для компании это меняет способ подготовки жалобы. Нельзя рассчитывать, что новый рассматривающий орган знает переписку с первоначальной инспекцией и восстановит ход проверки сам.

Соберите жалобу как самостоятельный комплект. По каждому спорному эпизоду укажите:

• вывод инспекции;
• норму, с которой он расходится;
• доказательство компании;
• расчёт спорной суммы;
• документ, подтверждающий фактические обстоятельства.

Если спор начался с акта проверки, сначала используйте месячный срок для письменных возражений. Как считать этот срок и выстроить доводы, описано в материале о структуре ответа компании на акт.

Что проверить руководителю сейчас

1. Сопоставьте отчётность с критериями ФНС: налоговую нагрузку, убытки за два года, долю вычетов по НДС, рост доходов и расходов, зарплату и рентабельность.

2. Проверьте, сколько раз компания меняла инспекцию и отвечала ли она на все требования о пояснениях и документах.

3. По каждому отклонению подготовьте объяснение и подтверждающие документы. Не исправляйте показатель только ради совпадения со среднеотраслевым значением.

4. Разберите посреднические операции и сделки с контрагентами, по которым документы не совпадают с фактическим исполнением.

5. Утвердите порядок действий при осмотре и выемке: кто встречает инспекторов, фиксирует переданные материалы и проверяет протоколы.

6. Если проверка выявила недоимку, рассчитайте налог и пени, затем проверьте условия освобождения от штрафа по ст. 122 НК РФ. Только после этого решайте вопрос об уточнённой декларации. ФНС считает добровольное уточнение приоритетным до выездной проверки, но освобождение от штрафа зависит от обстоятельств и соблюдения требований НК РФ.

Это общий порядок. Решение по конкретной компании зависит от отчётности, документов по сделкам и того, какие сведения уже получила инспекция.